Действие сериала разворачивается в 2371 году, когда новенький звездолёт «Вояджер», только что спущенный с верфи Объединённой Федерации Планет, получает первое боевое задание — выследить корабль организации «Маки», которая ведёт партизанскую войну против кардассианцев и преследуется Федерацией как террористическая группировка.
